台湾
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“超级手机号码追踪器”是一款在2011年5月于Apple App Store上架的软件，声称是使用美国中央情报局的卫星定位技术的手机追踪软件，只需输入对方的电话号码就能进行定位，售价$1.99美元。6月2日，台北市议员应晓薇召开记者会，指称是骗人软件，要求苹果退费。台北市政府法规会发出消费警讯，除要求该软件下架，并发函要求，在函到后15天之内必须修改服务条款，建立退费机制，业者若不配合，可依消保法第58条处6万至150万元罚款。
中国大陆
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参见：中国大陆区App Store下架VPN应用事件
2020年2月，苹果App Store开始要求所有游戏开发者在6月30日之前提供上架中国区App Store的游戏的游戏版号，此前，仅中国区游戏开发者在上架中国区App Store时需要提供版号；2020年8月1日和4日，App Store中国区下架了三万款游戏，2020年12月31日，App Store中国区下架47692款应用，其中绝大多数为无版号游戏，海外独立游戏损失惨重，《侠盗猎车手：罪恶都市》、《侠盗猎车手：圣安地列斯》、《侠盗猎车手III》、《Florence》、《刺客信条：本色》、《水果忍者》、《画中世界》、《饥荒：口袋版》、《地狱边境》、《这是我的战争》、《迷你地铁》、《瘟疫公司》等海外游戏均因为没有版号而遭遇下架，截止2021年1月4日，App Store中国区商店的付费游戏榜中仅剩94款游戏。[28]
2023年9月，苹果要求中国大陆区域的应用程序App必须具备有效的官方备案号才能上架。[29]
伊朗
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由于美国对伊朗的制裁，伊朗的iOS用户在下载app的时候，会出现1009错误代码而导致无法下载[30][31]，2016年9月，苹果突然对伊朗开放App Store的访问权限[32]，2017年，苹果从其应用商店中删除了几款流行的伊朗应用，并告诉开发者这些应用由于美国对伊朗的制裁而被移除。此举遭到伊朗电信部长的批评，并引发了伊朗iOS开发者的强烈反对[33]；2018年3月，苹果突然切断了App Store在伊朗的访问权限[34]。因为美国限制，苹果公司无法与伊朗有任何经济交往，所以iPhone只能以走私形式流入伊朗市场，伊朗开发者通常会上架到伊朗国内的iOS市场例如SibApp，这些第三方App Store方便伊朗国内用户绕过美国制裁安装应用和内购[35]，例如在伊朗打车软件Snapp的官网上，有Google Play和Cafe Bazaar的Android下载链接（2013年Google宣布对伊朗提供免费app下载服务[36]），也有伊朗国内的第三方iOS商店，但并没有App Store的下载链接[37]。
克里米亚
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由于美国在2015年1月加大对克里米亚的制裁，苹果公司宣布切断对克里米亚的服务，包括禁止克里米亚iOS开发者上架任何app[38]，且用户用克里米亚互联网从App Store下载任何app会出现一段俄语提示[39]：
Покупки не поддерживаются
Покупки недоступны в Вашем регионе согласно Регламенту (ЕC) Ne 1351/2014 Европейского Совета Исполнительному приказу Ne 13685 Президента
США.。
不支持购买
根据欧洲委员会（EC）No.1351/2014条例和美国总统No.13685行政命令，
您所在的地区无法购买。
同样，著名游戏贩售平台Steam也切断了对克里米亚半岛的服务[40]，阻止任何在克里米亚的人在其应用商店购买游戏。
同年一月，Google停止向克里米亚提供任何商业服务，包括Google Play。[41]
古巴
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由于美国的禁运政策，App Store不对古巴提供任何app的下载权限。[42]。
叙利亚
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由于美国的禁运政策，App Store不得向叙利亚提供服务，任何使用叙利亚IP地址试图从App Store（无论哪个区）下载app的人都会看到1009错误代码提示。[43]
美国
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2025年1月19日，App Store执行美国《保护美国人免受外国对手控制的应用程序侵害法案》，在美国区移除了Tiktok及多款字节跳动的App[44]。